Zoid是生活在银河的彼岸，拥有战斗意识的金属生命体。行星迎来最后一刻，人类寻找新的目标将地球作为第二故乡，但是由于zoid失控和意外的时间扭曲，21世纪的地球上突然出现了zoid。由于zoid的破坏和重复的地壳变动，地球一度毁灭了。莱奥以自己挖掘出的Bestriger为伙伴，与左右地球未来的少女莎莉开始了冒险之旅。